平行宇宙穿越学说;
忍者世界存在多个平行的世界,果心居士可能是来自另外一个世界的自来也,由于某种原因来到这个宇宙寻找楔子,于是暂时加入了慈玄的组织,所以能够使用螺旋丸的忍术,和蛤蟆通灵兽。这种可能比较类似复仇者联盟的套路,而且现在的世界已经进入了科技时代,因此平行宇宙的说法还是具有一定的可能性的。
秽土转生自来也复活学说:
果心居士可能是慈玄通过秽土转生之术复活的自来也,火影忍者后期大战中,同样是秽土转生的斑就是通过此术复活成为实体。那么这种情况也适用于自来也的身上,不过为什么黑化?是失去的记忆,还是另有目的?就不得而知的,需要看后面详细的剧情。